Las principales actividades de CESTES incluyen: realizar estudios e investigaciones, tanto de forma independiente como en colaboración con otras organizaciones, empresas y asociaciones; planificar y organizar actividades de investigación y consultoría; desarrollar y promover propuestas legislativas; promover debates, conferencias, seminarios y eventos a nivel nacional e internacional; publicar y difundir estudios; llevar a cabo otras actividades instrumentales o relacionadas con lo anterior; realizar análisis e investigaciones específicas; producir la revista trimestral PROTEO, libros, los Cuadernos del Centro de Estudios y otra documentación científica relacionada con los procesos de transformación política y socioambiental; es uno de los promotores del Laboratorio Europeo de Crítica Social (LCS); y promover y/o copromocionar seminarios y conferencias internacionales, particularmente en Europa y América Latina.